В начале правления Канси масштабное антицинское сопротивление в Китае в целом было подавлено, лишь Чжэн Цзин, сын Чжэн Чэнгуна, занявший Тайвань, продолжал соблюдать летосчисление династии Мин. Еще в 1667 г. цинское правительство планировало присоединить Тайвань к единому Китаю, но, не имея всех необходимых для этого условий, временно отложило эту идею. По отношению к режиму клана Чжэнов и к его подданным по-прежнему применялась тактика, согласно которой предпринимались попытки привлечь их на свою сторону, при этом морская торговля была запрещена, что оборвало связи клана Чжэнов с материковым Китаем. В 1674 г. Чжэн Цзин, воспользовавшись «мятежом трех князей-вассалов», объединил войска с Гэн Цзинчжуном и вторгся в Фуцзянь, занял Цюаньчжоу, Чжанчжоу, а также Чаочжоу и Хуэйчжоу в Гуандуне. После капитуляции Гэн Цзинчжуна Чжэн Цзин был вынужден отступить на Тайвань под давлением цинских войск. В самом начале 1682 г. Чжэн Цзин умер от болезни; его наследником был Чжэн Кэшуан. К этому времени продолжавшийся восемь лет «мятеж трех князей-вассалов» был уже усмирен, и цинское правительство, пользуясь сложившимися обстоятельствами, приняло решение присоединить Тайвань к единому Китаю, назначив помощника начальника императорской гвардии Ши Лана главой военного флота провинции Фуцзянь и направив его в Фуцзянь, где он должен был провести необходимые приготовления.
В середине 1683 г. Ши Лан, завершив все приготовления, возглавил флот численностью свыше 20000 человек на более чем 200 судах и отправился из Туншаня к архипелагу Пэнху. Лю Госюань, командующий обороной армии Чжэна, поспешно выступил ему навстречу. В ходе ожесточенной битвы армия Чжэна была разбита, потери составили свыше 200 боевых кораблей и более 12000 офицеров и солдат. Лю Госюань бежал обратно на Тайвань. Чжэн Кэшуан, узнав о поражении у Пэнху, сильно испугался. Ши Лан послал к нему людей с предложением перейти на сторону Цин, и Чжэн Кэшуан направил на переговоры в Фуцзянь Чжэн Пинъина и других. Переговоры зашли в тупик из-за многочисленных разногласий сторон относительно условий капитуляции. Император Канси, желая избавить себя от беспокойств, которые причинял ему клан Чжэнов, объявил, что капитулировавшие освобождаются от ответственности за свое прежнее сопротивление властям. Вскоре Чжэн Кэшуан послал людей к Ши Лану на Пэнху, передал ему свои грамоты и печати и объявил о капитуляции. Через месяц Ши Лан прибыл на Тайвань во главе цинского войска. Цинское правительство приняло решение учредить на Тайване округ-фу Тайвань, подчинявшийся провинции Фуцзянь. Для Тайваня была учреждена одна должность военного наместника, на островах Пэнху была учреждена одна должность помощника генерала — занимавшие их командовали войсками и отвечали за оборону. Таким образом, Тайвань был присоединен к единому Китаю под властью центрального правительства династии Цин.
